1、出资人不同：自然人独资企业是自然人独自出资设立，法人独资公司是法人独自出资设立；2、适用的法律不同：自然人独资适用《个人独资企业法》，法人独资适用《公司法》；3、承责制度不同：自然人独资企业是无限连带责任，法人独资公司可以独立担民责。一个自然人只能设立一个独资企业。一人有限责任公司，是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。依据我国相关法律的规定，一个自然人只能投资设立一个一人有限责任公司。该一人有限责任公司不能投资设立新的一人有限责任公司。一人有限责任公司应当在公司登记中注明自然人独资或者法人独资，并在公司营业执照中载明。《公司法》第五十七条 【一人公司的概念】一人有限责任公司的设立和组织机构，适用本节规定;本节没有规定的，适用本章第一节、第二节的规定。
本法所称一人有限责任公司，是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。
