根据《工资支付暂行规定》第十六条规定：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。”
公司无权随便扣除员工基本工资。至于属于浮动绩效工资、奖金的部分，在双方合同具体约定的情况下才可以扣除。如果员工的迟到行为没有造成用人单位直接经济损失，用人单位无权扣除员工工资。
综上所述，现在不少单位都会设置全勤奖，鼓励员工按时上班工作。如果员工全勤上班，单位就不能扣工资，员工发现自己工资少的，可以向人事部门反映，单位置之不理的话，本人要带上相关证明材料到劳动局举报，或者向劳动仲裁委员会申请仲裁。
