１、主体资格不同。
劳动合同的主体只能一方是
法人或组织，即用人单位，服务协议则必须是
劳动者个人。
２、主体性质及其关系不同。
劳动合同的双方主体间不仅存在财产关系即经济关系，还存在着人身关系，即行政隶属关系。劳动者除提供劳动之外，还要接受用人单位的管理，服从其安排，遵守其规章制度等，成为用人单位的内部职工。但服务协议的双方主体之间只存在财产关系，即经济关系，彼此之间无从属性，不存在行政隶属关系，劳动者提供劳务服务，用人单位支付劳务报酬，各自独立、地位平等。
３、主体的待遇不同。
劳动关系中的劳动者除获得
工资报酬外，还有保险、福利待遇等；而服务协议中的自然人，一般只获得
劳动报酬。
４、报酬的性质不同。
因劳动合同的履行而产生的劳动报酬，具有分配性质，体现按劳分配的原则，不完全和不直接随市场供求情况变动，其支付形式往往特定化为一种持续、定期的工资支付；因服务协议而取得的劳动报酬，按等价有偿的市场原则支付，完全由双方
当事人协商确定，是商品价格的一次性支付，商品价格是与市场的变化直接联系的。
５、用人单位的义务不同。
劳动合同的履行贯穿着国家的干预，为了保护劳动者，《
劳动法》给用人单位强制性地规定了许多义务，如必须为劳动者交纳
社会保险、用人单位支付劳动者的工资不得低于政府规定的当地
最低工资标准等，这些必须履行的法定义务，不得协商变更。服务协议的雇主一般没有上述义务，当然双方可以约定上述内容，也可以不存在上述内容。
