农村宅基地一般情况下是只有使用权的，而农村宅基地上的自建房是可以申请房产证的。
农民建房申请宅基地的审批程序
1、农村村民建住宅，首先向集体经济组织提出申请;
2、村集体经济组织对申请建房户在醒目的地方进行张榜公示(15个工作日以上);
3、国土资源管理所及镇社会事务办公室到实地对申请人是否符合条件，拟用地是否符合规划等进行初审;
4、公布期满无异议后，将符合“一户一基”条件的用地户按规定报乡镇人民政府审核后，报县人民政府审批(占用农用地的按规定报市政府办理农用地转用审批手续)。
5、宅基地批准后，国土资源所及镇社会事务办公室到实地批放宅基地，并发放选址意见书，规划许可证，施工许可证(“一书两证”)。
6、村民住宅建成后，国土资源所到实地检查是否按批准面积和要求使用土地，对符合要求的建房户核发集体土地使用证书。
7、村民凭土地使用证及规划许可证申请办理房屋所有权证。
所以，农村房屋的产权证的办理一共也就是分成两个流程。只不过需要向房管所提交的这些材料在办理起来的时候可能比较麻烦。比如说，农村自建房的验收证明，那村民还得寻找专业的对房屋质量进行验收的单位，在单位验收了以后才能够拿到报建验收证明，农村的房产证的办理是要先办理宅基地证的。
