行政诉讼的指定管辖，是指上级法院以指定行为将行政案件交由下级法院管辖的制度，即我国《行政诉讼法》第22条规定的两种情况：
一、由于特殊原因，致使有管辖权的法院不能行使管辖权的在这里，管辖权的行政诉讼的指定管辖，是指上级法院以指定行为将行政案件交由下级法院管辖的制度，即我国《行政诉讼法》第22条规定的两种情况：
1、由于特殊原因，致使有管辖权的法院不能行使管辖权的 在这里，管辖权的归属并没有疑问与纠纷，只是这种明确的管辖权由于以下特殊原因不能行使：
a、事实原因。自于自然灾害、战争、意外事故等不可抗拒的客观事实，使该法院实际不能行使职权；
b、法律原因。由于某些事实的出现符合法律规定，从而使有管辖权的法院在法律上不能审理或继续审理本案。如当事人申请回避，或法院订立规则，属本院工作人员为当事人的案件，本院不宜审理等。
2、由于法院之间对管辖权发生争议 下级法院之间如果就特定行政案件的管辖权发生争议，应当互相协商，如果协商不成，可报请它们共同的上一级法院，由该上一级法院以指定形式解决管辖冲突或争议。从实践来看，主要有这样一些情况：
a、积极冲突，即两个以上法院都以为自己拥有对本案的管辖权；
b、消极冲突，即两个以上法院均以为自己对本案无管辖权，应由对方法院受理。
法律规定，法院之间发生管辖权冲突或争议时，其处理程序是：先由争议法院互相协商，如果协商不成，则由争议的法院各自上报它们共同的上一级法院，也有争议法院单一上报的。上报应各自行文，陈述自己的理由。如果是涉及跨省、区的两个法院之间的争议，且协商不成的，则各自上报所在省高级人民法院，由高级人民法院上报最高人民法院予以指定。上级法院接到报告呈文后，应进行审查，并及时地作出指定管辖的决定，并以法院公函形式下达。
