船舶登记人和实际出资人不一致，可能会造成后面船舶所有权的争议问题，其登记人与实际出资人应就其船舶所有权及经营权等做一个书面的合同协议，明确双方权利义务关系。
根据相关法律规定，船舶所有人申请船舶所有权登记，应当向船籍港船舶登记机关交验足以证明其合法身份的文件，并提供有关船舶技术资料和船舶所有权取得的证明文件的正本、副本。
船籍港船舶登记机关应当对船舶所有权登记申请进行审查核实；对符合本条例规定的，应当自收到申请之日起7日内向船舶所有人颁发船舶所有权登记证书，授予船舶登记号码，并在船舶登记簿中载明下列事项：
（一）船舶名称、船舶呼号；
（二）船籍港和登记号码、登记标志；
（三）船舶所有人的名称、地址及其法定代表人的姓名；
（四）船舶所有权的取得方式和取得日期；
（五）船舶所有权登记日期；
（六）船舶建造商名称、建造日期和建造地点；
（七）船舶价值、船体材料和船舶主要技术数据；
（八）船舶的曾用名、原船籍港以及原船舶登记的注销或者中止的日期；
（九）船舶为数人共有的，还应当载明船舶共有人的共有情况；
（十）船舶所有人不实际使用和控制船舶的，还应当载明光船承租人或者船舶经营人的名称、地址及其法定代表人的姓名；
（十一）船舶已设定抵押权的，还应当载明船舶抵押权的设定情况。
船舶登记机关对不符合本条例规定的，应当自收到申请之日起7日内书面通知船舶所有人。
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