1、目的不同。
三方协议是毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定，是编制毕业生就业方案和将来双方订立
劳动合同的依据。而劳动合同主要是
劳动关系确立后使
劳动者和用人单位的合法权益得到应有的保障。
2、适用的法律不同。三方协议的制定、发生争议后的解决主要依据是《国家关于高校毕业生就业的规定》、《
民法》等，而劳动合同的订立以及发生争议后主要是依据《
劳动法》来解决。《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，简称“就业协议书”，俗称“三方协议”，是由教育部高校学生司统一制定的，各省市(自治区)教育主管部门印制的，为维护国家就业计划的严肃性，明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的
权利和义务，由毕业生、用人单位、学校三方签订的协议。劳动合同，又称为劳动契约、劳动协议，是指劳动者与用人单位(管理者、雇主)之间为了确定劳动关系，明确双方权利和义务而达成的协议。
