社保中断三个月就清零吗

不会的。
1、单位中断缴费(含未按时足额缴费)，医保暂停记入单位职工个人账户并封锁账户，停保期间产生的医疗费不予报销，由单位自筹资金按医保政策规定报销；
2、中断缴费一年以内续保的，自续保生效之日起发生的住院费可以报销，续保前产生住院费医保基金不予支付；中断缴费一年以上设有6个月的免付期。
如果没有间断缴费，或间断缴费没有超过一年，在住院当月缴费的情况下，不影响医疗保险报销。
社会保险中的养老保险是累积计算的，不会由于中间停止缴纳而清零。在中断之后有缴纳的，则以前参保的年限以及个人缴纳金额部分会累计的。而在一个医疗保险缴纳年度内，社保停止缴纳，医疗保险的缴纳年限清零，将重新计算。个人账户余额在重新缴纳医保后，将会激活并可以继续使用，因此个人缴纳的医保金额不会清零。