首先，用分公司的财产来清偿。虽然分公司不具备法人资格，但它是总公司依法设立并领取营业执照，具有一定的组织机构和财产，需要对自身的债务承担责任。
然后，分公司的财产无法清偿所有债务的，由总公司清偿剩下的部分。分公司的财产也是总公司财产的一部分，分公司在管理财产范围内承担责任实质上也是总公司承担责任，分公司的财产不足以清偿其债务的，就要总公司对其分公司债务承担补充责任。
根据债务金额大小选择被告
在小额诉讼中，将分公司列为被告，只要得到总公司的授权或者认可，分公司管理的财产又足以承担民事责任时，不需将总公司列为共同被告。
只有当债权数额巨大或者较大时分公司管理的财产不足以承担民事责任，或者所产生的争议较为复杂，超出了分公司处置的权限时，需要将公司列为共同被告。
