但宅基地是属于兄弟二人,兄弟二人签署一个宅基地分割协议书并进行公证是否具有法律保障？

当事人如果是本村农业户籍。就可以申请宅基地。
《农村宅基地管理办法》：第十七条 农村村民申请宅基地，应当向常住户口所在地的村民委员会或村集体经济组织提出书面申请，经村民委员会或村集体经济组织讨论同意，并将申请宅基地户主名单、家庭人口、原有房屋间数面积、申请建房占地面积、位置等张榜公布后无异议的，取得乡村建设规划许可证或建设用地规划许可证后，报乡(镇)人民政府审查，县土地行政主管部门审核，由县人民政府批准，其批准结果由村民委员会予以公布。