1、质证程序的启动
司法鉴定人出庭质证可以由案件的双方当事人提起，亦可以由法官提起，但最终决定权在法庭。
2、出庭通知
当事人申请司法鉴定人出庭的，应当在举证期限届满前7日内向法院提出书面申请。法院经审查同意后，应在开庭前三日向司法鉴定人送达出庭通知。
3、出庭
司法鉴定人按出庭通知书上规定的日期、时间准时出庭，并向法庭提供鉴定人的资格证明材料。这也可以称之为资格审查程序。首先，审判人员传司法鉴定人到庭;随后，审判人员审查司法鉴定人的身份信息、执业资质等情况;再后，审判长告知出庭作证的权利和义务。
4、出庭质证
申请出庭作证或质证方首先向鉴定人询问，然后由对方询问，法官只在必要时对鉴定人作一些补充性的询问。鉴定人在法庭上必须陈述所作鉴定结论的根据、过程和科学基础，回答相关各方提出的疑问，司法鉴定人在法庭上对案件公诉人、辩护人、当事人、代理人、法官以及具有专门知识的人员依照法律程序对作为证据的鉴定意见提出的有关问题应以通俗易懂的语言如实回答。
5、核对笔录
法庭质证完毕后，审判长宣布鉴定人退庭时，鉴定人即可退出法庭并在庭外等候，待庭审结束后核对庭审笔录、签字。鉴定人对质证笔录应仔细阅读，如果没有错误，即可签名。如有错误，提请法官改正笔录。笔录改正后，再签名。
鉴定人一般都是与案件没有什么利益关系的人，但是拥有专门的知识技能，能够帮助案件尽快地解决。所以不论是民事案件还是行政案件，鉴定人的出庭都是没有什么区别的，司法机关应该完善鉴定制度，加强司法鉴定的监督，防止出现不良现象。
