1、司法鉴定时效问题
目前的工程质量司法鉴定是以现状为准去评判工程质量，而工程质量有部分是随着时间而变化的，也就是说现状评判不合格不能代表当时施工时不合格，因此有时无法去推断工程施工时的质量情况。权宜之计是，根据保修期进行判定，即若工程质量在保修期内的出现了工程质量问题，就可以按照工程质量施工验收标准进行判定，而不用考虑时间因素对工程质量的影响。
目前我国工程质量保修期限的约定有两个方面：一是双方约定正常使用年限；若没有约定，则根据国务院令《建设工程质量管理条例》关于建设工程质量最低保修期的规定。
2、工程质量司法鉴定与施工质量验收不同
施工质量验收属于过程检验，施工过程中随时进行检验批的抽样验收，最后对单位工程或分部工程质量做出整体评定结论；而司法鉴定属于现状检验，无法对施工过程进行鉴定。受检验批抽样比例和检测手段的限制，相当多的检验项目事后无法进行复查。因此鉴定时，应让委托方明确鉴定事项，针对检测手段不能达到的检测项目事先告知委托方。
综上所述，在工程建设过程中，发生质量问题的情况比较普遍，因此发生纠纷时，做一个司法鉴定就显得比较重要。砌体工程质量司法鉴定应该找专业的司法鉴定机构来做，当事人提出申请后，司法鉴定机构会派人来现场检测抽样，然后对数据进行分析，经过专家讨论，出具工程质量鉴定报告。
