按照最高人民法院《人民法院诉讼收费办法》的规定，鉴定费由申请人垫付，由人民法院根据具体情况，决定当事人双方应负担的金额。但是，这个《办法》已经废止。
现行国务院《诉讼费用交纳办法》规定，鉴定费实行“谁主张、谁负担”的原则，由当事人直接支付给鉴定机构。司法鉴定费用由败诉方承担，鉴定费由负担举证义务的一方垫付。由法院根据案情，法院判决如果全部败诉当然是全部由败诉方承担。如果有一部分诉求得到支持，各承担一部分。
司法鉴定对于案件的当事人来说十分重要，它甚至可以直接决定案件的走向，因此有许多案件当事人可能会做出提供虚假鉴定材料等行为，无论是案件的当事人还是司法鉴定机构工作人员都应严格遵守法律规定，否则会承担一定的法律责任。
