公司今年4-5月份把订单转移到其他分厂，

是否将劳动合同转移至子公司存在几个问题
1，公司分立，设立的子公司是独立法人还是依托母体的分支机构前者应当签订新的劳动合同，解除原公司的劳动关系；后者则不能解除关系（子公司依托母体没有独立的用人资格）
2，关于社保先解除原劳动关系，之后携带相关材料和新公司签订劳动合同，并由新公司人事办理社保转接手续，注意看着点，别让社保出现中断一个月的情况，建议在新公司劳动保障登记证办理完毕后再建立劳动关系
3，关于工作年限的连续性重点是看在和母公司解除劳动关系时母公司是否支付了相应补偿，则可以视为解除关系，到新公司劳动年限连续性重新计算；如果没有支付补偿，则新公司应当接受原有的劳动年限连续关系注意：在有些单位，单位分立子公司时，会以要建立新的劳动关系为由，要求员工先辞职，由于辞职是劳动者单方面行为，这样公司可以不花一分钱就中断劳动者的工作年限，而新公司则从头再接受劳动者和劳动关系，所以在变更劳动关系时，一定不要走辞职-新上岗路线，一定要原公司给予足够的补偿或书面确认连续劳动关系，最大程度保障职工利益

您好，要计入的不是这三个月。如果单位存在违法行为，您可以申请劳动仲裁主张您的合法权利。