商转公贷款目前有两种办理方式，一种是先还后贷方式，另一种是以贷冲贷方式。先还后贷方式是指已办理商贷的职工向中心申请商转公贷款，经中心同意后，职工以自筹资金还清商贷并办理担保手续后，中心再发放商转公贷款。以贷冲贷方式是指已办理商贷的借款人向中心申请商转公贷款，经中心同意后，借款人将商贷本息余额大于商转公贷款差额提前还清，并办理担保手续，中心发放商转公贷款，借款人、担保公司、银行共同配合用商转公贷款还清商贷并办理住房抵押反担保手续
例如在长沙：长沙个人自购住房商业银行贷款转为公积金贷款，取消原规定购房合同年限，只要是属于个人住房商业银行的贷款都可以转为公积金贷款，但转入公积金贷款必须符合公积金贷款条件，贷款金额不能超过原商业银行贷款的余额，同时不能超过公积金最高贷款额度。
申请商转公贷款需提供以下材料：
（一）借款人及产权共有人具有法律效力的身份证明及婚姻证明。
（二）住房公积金储存卡。
（三）商贷借款合同。
（四）所购房屋的《房屋所有权证》和《国有土地使用权证》，采用以贷冲贷方式的必须提供原件，采用先还后贷方式的可提供经银行确认的复印件。
（五）用于偿还商转公贷款的银行卡或活期存折。
（六）住房公积金个人贷款相关规定要求提供的其他材料。
但是，商业贷款转公积金贷款手续复杂，而且有的地方可以申请，有的地方则没有这种政策。
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