土地流转中纠纷产生的原因：土地承包权不清。土地流转过程中农户间的纠纷可以归结为承包权不清引起的经济纠纷。随着国家对农业税的取缔，对农业补贴的实施以及农产品价格的回升，使农业收益有了显著提高，从而加大了农民外出务工的机会成本。在经济利益的驱动下，作为“理性经济人”的农户纷纷返乡务农。而返乡农户原有土地现在的经营者也因收益的增加而不愿放弃土地的经营权。由于对同一块土地的承包权不清，从而引发了农户间的纠纷。
农民缺乏维权意识和法律知识。我国《土地承包法》中规定了土地流转的程序，但在生活实践中，大多数农民不熟悉土地流转的方式、程序，大多采用口头协议形式，缺乏必要的书面形式，导致在实践中土地流转行为不够规范，得不到法律的维护。因此也就容易产生纠纷，而一旦发生纠纷，无书面凭证就难以了解双方当事人土地流转时的真实情况。在农民的利益受到损失时，由于农民法律意识的淡薄、对法律的不重视、感性化的思维方式从而使自己的利益无法受到法律的保护。
综上所述，农民之间转让土地的时候，如果合同条款存在重大误解，就容易导致土地转让合同纠纷事件的发生。作为合同当事人，应该首先选择协商解决矛盾，没有达到效果的话，可以要求村委会调解。在村委会调解无效的情况下，农民还可以选择仲裁甚至诉讼的方式解决，这些都是合法合理的手段。
