在职仲裁后离职，单位会如何处理

在职期间申请仲裁后离职，单位有不同处理方式。
经济补偿上，若仲裁裁决单位支付经济补偿、工资差额等，单位认可结果，会在规定时间付款；若不服，会在法定期限起诉至法院。
工作交接方面，单位要求离职员工按规定交接工作资料、办公用品。员工要配合完成交接，不然单位可能暂扣经济补偿等款项，直到交接完成。
人事档案和社保方面，员工离职后，单位需依法办理档案和社保关系转移。单位不履行，员工可向劳动行政部门投诉，促其办理。
后续关系处理上，若双方矛盾小，单位会理性处理。若单位觉得员工仲裁造成不良影响，在开具离职证明、配合工作背景调查时可能不积极。但单位有义务如实提供情况，不能故意作虚假陈述诋毁员工。
建议员工离职时按规定交接工作，若单位不履行支付款项、办理档案和社保转移等义务，通过合法途径维护权益。出现单位故意诋毁情况，及时收集证据，必要时通过法律手段解决。

案情回顾:

小朱在职期间因经济补偿、工资差额等问题与单位产生纠纷，遂申请仲裁后离职。仲裁裁决单位需支付小朱经济补偿等款项，单位对裁决结果不服，在法定期限内准备向法院提起诉讼。同时，单位要求小朱进行工作交接，小朱未及时配合，单位表示将暂扣经济补偿。此外，小朱担心单位不办理档案和社保转移手续，双方因此产生矛盾。

案情分析:

1、在经济补偿支付上，若法院最终维持仲裁裁决，单位应按结果支付款项；若单位胜诉，则无需支付。
2、工作交接是员工离职时应尽的义务，单位有权暂扣补偿直至交接完成。
3、单位有义务在员工离职后依法办理档案和社保转移手续，小朱可通过向劳动行政部门投诉等方式要求单位履行该项义务。
4、单位在办理离职证明、工作背景调查等事项时应如实提供情况，不得故意作虚假陈述诋毁小朱。