通过增值税发票税控系统对增值税发票所包含的数据进行识别、确认都叫增值税发票认证。
认定流程：
一、程序
1、电脑联网，扫描仪正常连接运行。留抵没有期限规定，只要企业持续经营，就能在以后各期抵扣，如果企业清算、注销，要将没有抵扣完的留抵额做进项税额转出。
2、打开相关“网上认证程序”，找到相关“网上认证采集模块”，执行“发票扫描录入”，将需要认证的增值税专用发票抵扣联，逐一放置扫描仪中扫描采集；
3、每批次扫描采集完后，执行程序界面上的“保存”，通过“网上认证程序”中“信息发送”按钮发送上传到国税机关，待反馈信息，及时获取成功信息后，则通过认证；不符者，仔细校对再执行上述步聚（也可通过手工录入校正）；至此“网上认证”完成。
二、期限增值税一般纳税人，在收到增值税专用发票后，在发票开具日期起180天之内认证，可以抵扣进项税，当期够抵扣不完的，可以留抵。
