1、客观因素。司法实践中，一方提出重新鉴定申请主要是针对当事人自行委托鉴定机构所作的司法鉴定书。在重新鉴定申请被依法准许后，被鉴定人往往会以该鉴定结论程序合法、鉴定人员资质合格，该鉴定结论客观有据为由予以抗辩，并拒绝进行重新鉴定。
2、心理因素。司法实践中，司法鉴定可以由法院委托、当事人自行委托、双方当事人协商进行，其中自行委托鉴定出现问题的可能性比较大，出于各方压力、人情世故等因素的考虑，有些鉴定结构做出的司法鉴定不一定是合法合理的。在一方申请重新鉴定的情况下，出于人的本性，当事人往往会出现害怕重新鉴定改变原先鉴定结论的心理，因此，他们以没有时间等各种原因搪塞，拒不配合进行重新鉴定。而且法律没有规定相应的惩罚措施，客观上被鉴定人摆脱了“心理负担”。也有的当事人担心每个鉴定机构人员素质不同、看法不同，可能会对相同的伤情作出不同的鉴定结论，为此拒绝配合重新鉴定。
3、立法因素。重新鉴定是法律赋予当事人的权力，但这种权力不能滥用，为此，《证据规定》对重新鉴定的申请条件以及何种情况下人民法院应该准许都作出了严格的限制，比如《证据规定》第二十八条：“一方当事人自行委托有关部门作出的鉴定结论，另一方当事人有证据足以反驳并申请重新鉴定的，人民法院应予准许。”也即只有当时人有证据足以反驳才能进行重新鉴定，由于鉴定结论对审判的重要性，人民法院对重新鉴定一般会予以准许，但被鉴定人往往视此为“救命稻草”，拒不配合重新鉴定。
鉴定结论作为证据之一，它的科学性、真实性直接关系到案件的实体审理。为此，《证据规定》规定了当事人申请重新鉴定的情形，目的就是为了更好地还原事情真相，保障各方当事人的权益。但是，法院启动重新鉴定程序后，被鉴定人却拒绝配合的，应如何处理?这一问题目前还是法律规定的盲区。
综上所述，对于一审法官拒绝笔迹鉴定肯定是有相关的法律依据的，如果笔迹鉴定并不能适合案件进一步，对案件并没有发展帮助的，那么法官也是可以拒绝申请人对笔迹鉴定的申请的。
