软件侵权所造成的间接损失主要为权利人行使软件作品著作权的可得利益损失。这些损失包括权利人丧失的市场份额及市场竞争力上的削弱，以及商业信誉的损失。此外，对于用制止侵权行为的合理费用也应计算在内。
(一)在实践中，制止侵权行为的合理费用的范围一般包括：
(1)合理的律师费用;
(2)调查取证及为制止侵权行为所支付的正当差旅费等;
(3)为举证而查阅、复印有关资料而支付的合理费用;
(4)合理的鉴定费以及办理证据保全公证费用等其他合理费用。
但是涉及到计算机侵权赔偿的细节的时候是一个漫长而又浩大的工程，要计算好自己的损失，然后再规定的范围内要求对方去赔偿。其中包括调查取证的费用还有正常支付的差旅费用以及查阅的时候所支付的费用，侵权方都是要赔偿的。
