工程预付款的扣回问题直接关系工程建设资金的投入和建设单位资金风险，工程建设资金投入又直接影响施工企业的资金安排，从而对工程项目的建设进度造成影响，最终影响建设单位的投资回报，工程预付款的扣回问题在国内许多建设工程施工合同中未作详细约定，有的约定在竣工决算后支付尾款中抵扣，有的约定在后期工程款中一次性抵扣，这种不考虑与工程建设进度情况相适应的约定极易造成工程款支付方面的纠纷，如工程实施过程中产生其它纠纷，也可能引起因工程预付款支付和扣回约定的不详细而造成双方对工程款实际支付数额的异议。下面就工程预付款的扣回问题简要的介绍国内工程管理公认的扣回方式和一种国际上通用的扣回方式：
1.工程预付款的扣回方式有两个关键要素：第一个是工程预付款支付后从何时开始扣回即起扣点，另一个要素是怎样扣回，扣回的比例是多少即扣回比例。在国内工程建设中，工程预付款的作用主要是建设单位在工程开工前支付给施工企业的材料和设备等的购置资金，该项资金的具体数额根据双方签订的工程合同金额及该工程项目所需的材料、设备占整个工程造价的比重来确定，故在工程预付款确定前必须对材料和设备所占整个工程造价的比重进行测算，测算出材料和设备占整个工程造价的百分比，然后我们可通过一个经验公式来确定工程预付款的起扣点，即：预付款起扣点=合同总价-工程预付款/材料和设备占工程造价的百分比，扣回数额为当月应支付进度款×材料和设备占工程造价的百分比，直至扣回完毕，正常的工业和民用建筑工程合同按此条件进行谈判多数能为双方接受，且不至于款项扣回超前而影响工程建设进度及预付款扣回不及时给建设单位造成经济风险。
2.FIDIC《施工合同条件》(用于雇主设计的建筑和工程)中关于预付款的扣回是这样规定的：预付款应通过付款证书中按百分比扣减的方式付还。除非投标书附录中规定其他百分比：
(1)扣减应从确认的期中付款(不包括预付款、扣减额和保留金的付还)累计额超过中标合同金额减去暂列金额后余额的百分之十(10%)时的付款证书开始(即“起扣点”);
(2)扣减应按每次付款证书中金额(不包括预付款、扣减额和保留金的付还)的四分之一(25%)的摊还比率，并按预付款的货币和比例计算，直到预付款还清为止。如果在颁发工程接收证书前，或根据合同终止条款的规定终止前，预付款尚未还清，则全部余额应立即成为承包商对雇主的到期应付款。
上述FIDIC的规定适用于大部分工程建设的预付款扣回方式，我们在签订合同时可根据不同的工程类型的建设周期和材料所占工程造价的比重对合同条款中的具体起扣点及扣回比例进行约定。
综上所述，对于工程预付款纠纷解决有很多方式，在进行工程中需要提前签订合同，假如在支付工程预付款后，施工企业假如迟迟不开工，对工程产生严重的影响时候，可以逐渐支付的方式用来解决，或者扣减付款证书的金额。更多相关知识您可以咨询律师365咸宁律师。
