土地纠纷调处的程序因争议双方的主体不同而有不同。依照我国《土地管理法》第十三条规定：
1、土地所有权和使用权的争议先由当事人协商解决。
2、土地争议双方协商不成的，由当地人民政府土地管理部门进行调解，签订权属地界协议书。
3、协商、调解不成的，按《土地管理法》第十三条规定：全民所有制单位之间、集体所有制单位之间、全民所有制单位和集体所有制单位之间的土地所有权和使用权的争议，由区，县级以上人民政府做出处理决定。如属个人之间、个人与全民所有制单位和集体所有制单位之间的土地使用权的争议，由乡级人民政府或区、县级人民政府做出处理决定。
4、发生严重的侵犯行为，引起重大的财产损失和人身事故，触犯法律的可直接由人民检察院或人民法院处理。
