司法鉴定人进行鉴定，应当对鉴定过程进行实时记录并签名。记录可以采取笔记、录音、录像、拍照等方式。记录的内容应当真实、客观、准确、完整、清晰，记录的文本或者音像载体应当妥善保存。
在医疗事故鉴定过程中，只规定了应当将，鉴定过程如实记录，没有像司法鉴定这面全面的记录方式。
其中，如果需要对受害人进行检查的、对重要检材取证的，司法鉴定规则做出了特别的规定：
1、需要对女性作妇科检查的，应当由女性司法鉴定人进行；无女性司法鉴定人的，应当有女性工作人员在场。
2、在鉴定过程中需要对未成年人的身体进行检查的，应当通知其监护人到场。监护人通常是未成年人的父母、成年兄弟姐妹、或者有监护能力的单位、亲属、朋友。
3、对被鉴定人进行法医精神病鉴定的，应当通知委托人或者被鉴定人的近亲属或者监护人到场。
4、对需要到现场提取检材的，应当由不少于二名司法鉴定人提取，并通知委托人到场见证。
5、对需要进行尸体解剖的，应当通知委托人或者死者的近亲属或者监护人到场见证。
这些特别的规定，充分保障了鉴定结论的客观、公正性。保证了司法鉴定的“公信力”。由于司法鉴定是最早是“来源于刑侦鉴定（死亡原因、毒理、物品痕迹、现场痕迹、文检、尸解）、交通事故鉴定”的。是相关技术部门在业务范围上的“拓展”，所以，在鉴定的程序上要明显严格于医疗事故鉴定。在医疗事故鉴定规则中，没有相关的规定。
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