实行综合工时制劳资双方你情我愿即生效吗

生效。
《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》规定，“企业对符合下列条件之一的职工，可实行综合计算工时工作制，即分别以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。”
“中央直属企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的，经国务院行业主管部门审核，报国务院劳动行政部门批准。地方企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的审批办法，由各省、自治区、直辖市人民政府劳动行政部门制定，报国务院劳动行政部门备案。”
即国家对企业实行综合计算工时工作制，不仅有着明确行业限制，而且要求必须严格履行审批手续。