有违建的房子能办理不动产登记吗怎么办

违法建筑在法律层面上是不被允许进行不动产权证办理的。
根据相关法律条文，若登记申请包含以下任一情况，那么依据现行法规，此项请求将被不动产登记机构予以拒绝，该机构同时应向申请人发出书面公告以充分表明理由：
（一）相关行为与法律、行政法规相抵触；
（二）存在尚未得到妥善处理的权属争议；
（三）申请登记的不动产权利超过法定时限。

《中华人民共和国城市房地产管理法》第六十一条以出让或者划拨方式取得土地使用权，应当向县级以上地方人民政府土地管理部门申请登记，经县级以上地方人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府颁发土地使用权证书。
在依法取得的房地产开发用地上建成房屋的，应当凭土地使用权证书向县级以上地方人民政府房产管理部门申请登记，由县级以上地方人民政府房产管理部门核实并颁发房屋所有权证书。
房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。
法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。