单位要病事假从年休假中扣除工资合法吗

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您好，对于您提出的问题，我的解答是, 病假医学诊断证明书不会有扣除公休日的表述。
病假单，是医疗机构执业医师出具的医学诊断证明书，建议休息的时间是“天”，按《执业医师法》和各地规范，不得有扣除公休日的表述。“天”是指自然日历数，病假时间是按照自然日历数计算。但是，在计算病假工资的支付的时候，按劳动和社会保障部《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》【劳社部发[2008]3号，休息日不带薪，计算病假工资应当扣除休息日。
《执业医师法》
第二十三条医师实施医疗、预防、保健措施，签署有关医学证明文件，必须亲自诊查调查，并按照规定及时填写医学文书，不得隐匿、伪造或者销毁医学文书及有关资料。
医师不得出具与自己执业范围无关或者与执业类别不相符的医学证明文件。
劳动和社会保障部
《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》
劳社部发[2008]3号
制度工作时间的计算
年工作日：365天-104天（休息日）-11天（法定节假日）=250天
季工作日：250天÷4季=6
2.5天/季
月工作日：250天÷12月=20.83天/月
工作小时数的计算：以月、季、年的工作日乘以每日的8小时。
工资折换
日工资和小时工资的折算
按照《劳动法》第五十一条的规定，法定节假日用人单位应当依法支付工资，即折算日工资、小时工资时不剔除国家规定的11天法定节假日。据此，日工资、小时工资的折算为：
日工资：月工资收入÷月计薪天数
小时工资：月工资收入÷（月计薪天数×8小时）。
月计薪天数=（365天-104天）÷12月=2
1.75天