我公司要发年终奖了，年终奖计入加班工资系数吗？

首先可以肯定，税是一定要交的。
一、加班工资并入发放当月的工资薪金计算缴纳个人所得税。
二、年终奖单独作为一个月的工资薪来进行处理。计算方法是：
1、首先用费用扣标准2000元当员工当月的工资作比较（如有加班工资，也要算进当月工资）。如果当月工资小于2000元，则用[年终奖-（2000-当月工资）]÷12,依据这个商数在工资薪金表里找对应的税率和速算扣除数，再用[年终奖-（2000-当月工资）]×对应的税率-速算扣除数，即可得出年终奖应承担的税额；如果大于2000元，则直接用（年终奖÷12）,依据这个商数在工资薪金表里找对应的税率和速算扣除数，再用（年终奖×对应的税率-速算扣除数），即可得出年终奖应承担的税额。
2、账务处理：加班工资并进当工资。借：管理费用
贷：应付职工薪酬
应交税费-应交个人所得税
扣缴税款时：借：应交税费-应交个人所得税
贷：银行存款（库存现金）