我二哥觉得拿的加班费不对，请问加班工资缴纳个人所得税吗

需要的。
根据我国劳动法的规定，用人单位在休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资200%的工资报酬;在法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资300%的工资报酬。
根据税务部门的相关解释，个人在国庆、“五一”等法定节假日加班所取得的两倍或三倍加班工资，不属于可免征个税的补贴、津贴，也要依法纳税。