违法收购废电瓶6吨被派出所扣了所有电瓶

是违法的，会被罚款，不会被拘留。根据《危险废物经营许可证管理办法》第二十三条规定：由县级以上地方人民政府环境保护主管部门责令停止违法行为；有违法所得的，没收违法所得；违法所得超过10万元的，并处违法所得1倍以上2倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足10万元的，处5万元以上10万元以下的罚款。