休年假扣全勤奖合法吗？

结论：不合法。
解析：
休年假扣全勤奖不合法。
工资是指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬，一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。
依据此规定，劳动者应获得的全勤奖属于工资范畴，其工作单位不应因员工依法休带薪年休假而减少员工的工资收入，其中包括奖金收入。
法律依据：
《职工带薪年休假条例》第二条
机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作一年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。
单位应当保证职工享受年休假。
职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入《企业职工带薪年休假实施办法》第十条
用人单位经职工同意不安排年休假或者安排职工休假天数少于应休年休假天数的，应当在本年度内对职工应休未休年休假天数，按照其日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。