防范信用风险
在普通仓单质押贷款的操作中，信用风险是最主要最基础的风险，是指货主企业和第三方企业的资信风险，即关于货物价值和仓单代表的权利的风险。所以，银行在资信考察方面首先要注意考察货主企业和第三方企业的经营能力、经营状况、在行业中所处的位置及其资产负债情况等经济信息。另外，还要注意其所处的信用环境，尤其是其历史履约状况和履约意愿，杜绝与有不良信用记录的伙伴合作。
防范市场风险
市场风险主要是指由于市场价格波动导致的仓单货物损失的风险。防范这个风险要注意从两个方面着手：
第一，注意质押商品的选择。不是所有的商品都适合仓单质押，要选择适用广泛、易于处置、价格涨跌幅度不大、性质稳定的商品作为仓单质押商品。
第二，注意仓单代表价值的足额与充分。由于评估机构的资质及信誉问题，仓单质押货物评估价值中会有泡沫，质押货物价值也会因市场价值的变化而导致质物的不足额不充分。因此，银行一定要选择资质好、信誉佳、水平高的评估机构。同时要有专门负责人适时披露风险点，对损失严重的质物要求增加足额充分的担保。
防范法律风险
法律风险主要是指由于不能满足或违反法律要求导致银行发生法律纠纷而带来的风险。防范法律风险要做到留置权不应优先于质权。根据我国《担保法》和《合同法》规定，仓储合同的保管人对保管货物享有留置权，而该留置权优先于质权的行使，因此当货主与仓储机构发生费用纠纷，仓储机构行使留置权时就可能影响到银行质权的实行。银行可与仓储机构在协议中约定留置权的行使不应优先于质权.
此外，银行还要注意质物来源的合法性，不合法货物的质押是无效的，尤其是对于走私及违禁物品要及时举报。
