其实三月份入职的，九月份才签的劳动合同，但是合同上的生效日期事三月份的?

很正常，劳动合同生效日期，是按照上班第一天开始算的。

合同生效日期写三月份没问题，这视为双方对劳动关系起始时间的追认。不过，从三月入职到九月签合同期间，若单位没及时签合同，员工有权主张四月到八月期间的双倍工资。员工可先和单位友好沟通此事，若协商不成，可收集能证明劳动关系和入职时间的证据，通过合法途径维权。