一般知识产权侵权行为发生时，可以先与侵权者协商解决，当协商不成时可以通过以下方式综合处理：
(一)工商局查处、专利局查处、版权局(文化执法大队)查处：
通过向工商局、专利局、版权局(文化执法大队)举报，要求侵权企业停止侵权，同时对其进行行政处罚。
(二)向公安局或海关等机关查处：
向公安机关举报检举，请求对侵权方责任人予以刑事处罚，从而从根本上制止侵权行为再次发生。涉及海关备案、海关知识产权保护向海关提出查处。
(三)人民法院起诉
通过诉讼，请求人民法院判令侵权方停止侵权，赔偿损失。一般分为民事纠纷案件、行政诉讼案件、侵犯知识产权的刑事案件。
人民法院受理的知识产权案件主要有三类：第一类是民事纠纷案件，包括各种知识产权合同纠纷案件，各种侵犯知识产权的侵权纠纷案件，以及知识产权案件中有关赔偿责任和赔偿数额的纠纷，经主管行政管理部门调处后，当事人不服向人民法院提起的诉讼案件;第二类是行政诉讼案件，主要指当事人对知识产权行政管理部门所作的行政处罚不服，向人民法院提起诉讼的案件;第三类是侵犯知识产权，构成犯罪，而由人民法院审理的刑事案件。这种保护主要适用于知识产权权利人的利益遭受严重侵犯，并造成重大损失的情况。
(四)其他行政部门查处
与知识产权相关侵权行为涉及的行政部门。如食品工艺可能需要相关监管部门介入。
一般来说，各个部门查处并非完全独立，有时需要同时使用多个机关同时对侵权行为进行查处维权。企业当发现知识产权侵权时应及时维权，这样才能有效维护企业的知识产权价值。
对知识产权的保护要从不同的层面来看，首先大方向上，肯定是国家在立法上面，加强对知识产权的保护，不断完善现有的保护机制。同时与国际接轨，建立健全知识产权法律体系。而对于各企业而言，在对知识产权的保护上面，其实就是要按照有关规定办理相应的注册登记，以获取来自法律、法规的保护。而实践中，也要定期加强对侵犯自己知识产权行为的打击。
