工程鉴定机构不公平该怎么办

1、工程鉴定机构不公平可以提出有相应资质的鉴定机构申请重新鉴定，一并向当地政府住建局的建筑工程质量监督站投诉，或者向建设行政主管部门或者其他有关部门进行检举、控告、投诉。
2、法律依据：《建筑法》第六十一条
交付竣工验收的建筑工程，必须符合规定的建筑工程质量标准，有完整的工程技术经济资料和经签署的工程保修书，并具备国家规定的其他竣工条件。建筑工程竣工经验收合格后，方可交付使用；未经验收或者验收不合格的，不得交付使用。