农村有房产证再买算二套房吗

不算。

农村有房再买楼房不算二套房，因为农村房屋没有产权登记，仅仅是土地使用权证。我国土地归国家所有，其中城市土地归国家所有，农村土地归集体所有。
房产调控政策中的一套、二套等指定是商品房是国有土地房产。所以，农村的房屋不是首套房。宅基地是农村的农户或个人用作住宅基地而占有、利用本集体所有的土地。
包括建了房屋的、建过房屋或者决定用于建造房屋的土地，建了房屋的土地、建过房屋但已无上盖物或不能居住的土地以及准备建房用的规划地等几种类型。
二套房指以借款人家庭为单位认定的，借款人家庭人均住房面积低于当地平均水平的，再次向商业银行申请住房贷款的房贷房。新出台的二套房标准既认房又认贷，且异地人士购房贷款还需提供1年以上拟购房地的纳税证明或社会保险缴纳证明，否则均按照二套房贷计算。
每个地区的二套房认定标准都不一样，一般情况下，咨询当地房产中介就可以了解首套房的详细内容了。以下是二套房认定标准，仅供参考：
1、父母名下有房产，以未成年的子女名义再购房的;
2、未成年的时候名下已有房产，成年后再次贷款购房的;
3、个人名下已持有全款购买的住房，再次贷款购房的;
4、个人名下还有贷款购买的住房，在贷款结清出售之后再次贷款购房;
5、第一次购房使用商业贷款，而再次购房使用公积金贷款的;
6、婚前一方曾经有贷款购房，婚后以另一方的名义进行申请贷款购房，但夫妻双方的户口没有在一起;
7、婚后夫妻双方共同贷款购房，离异后一方再次申请贷款购房。

《城市房地产开发经营管理条例》第三十三条
预售商品房的购买人应当自商品房交付使用之日起90日内，办理土地使用权变更和房屋所有权登记手续；现售商品房的购买人应当自销售合同签订之日起90日内，办理土地使用权变更和房屋所有权登记手续。房地产开发企业应当协助商品房购买人办理土地使用权变更和房屋所有权登记手续，并提供必要的证明文件。