已登记实缴出资又签借款协议怎么处理

已登记实缴出资后又签订借款协议，处理方式因情况而异。
当实缴出资和借款协议是相互独立的法律行为时，出资是股东为获取股权向公司注入资金，借款则是公司与股东或他人之间的债权债务关系。对于出资部分，依照公司法，股东享有对应股东权利，承担有限责任；借款部分，依据民法典合同编，出借人可要求借款人按约定还本付息。
要是出现股东以借款形式抽逃出资的情况，按照公司法，公司或其他股东能要求抽逃出资的股东返还出资本息，协助抽逃出资的其他股东、董事、高级管理人员或实际控制人要承担连带责任。公司债权人也有权要求抽逃出资的股东在抽逃出资本息范围内，对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。
若对出资性质有争议，觉得名为出资实为借款，要结合相关证据判断，像双方真实意思表示、款项用途、是否参与公司经营管理等。若能证明是借款，就按借款关系处理。
建议遇到这类问题，先收集好相关证据，如协议、转账记录等。若协商无法解决，可通过法律途径维护自身权益。

案情回顾:

小朱向公司实缴出资后，又与公司签订了借款协议。之后，小朱与公司就款项性质产生争议，小朱认为该款项是借款，公司则主张是出资。此外，其他股东怀疑小朱以借款形式抽逃出资。

案情分析:

1、若实缴出资和借款协议是独立法律行为，出资部分小朱作为股东享有相应股东权利并承担有限责任，借款部分小朱有权按民法典合同编规定要求公司还本付息。
2、若小朱存在以借款形式抽逃出资的情形，公司或其他股东可要求小朱返还出资本息，协助抽逃的人员承担连带责任，公司债权人可要求小朱在抽逃出资本息范围内对公司债务不能清偿部分承担补充赔偿责任。
3、对于出资性质争议，需结合双方真实意思表示、款项用途、是否参与公司经营管理等证据判断，若能证明是借款，则按借款关系处理。