1、平衡群众利益诉求难
在征地过程中，被征地农户最关心、最看重的是看得见、摸得着的经济利益。因此，一部分征地户为了获取更大的经济利益，想千方设百计寻求自认为合理的要求，常常采取不签字、阻挠工程进度等方式，谋求不正当权益。加之征地拆迁涉及面广、人口多，又涉及到自身的利益，往往极易抱团，极少数人别有用心的加以煽动，出谋划策以此缠住政府，提出与征地政策相悖的要求。极少数地方政府为了推进征地工作，甚至做出让步，放弃原则息事宁人，满足和部分满足非正当诉求，无形之中增加征地拆迁的难度和成本。
2、处置违规“抢种抢建”难
在基层征地拆迁具体工作中，出现一种怪现象，就是规划到哪里，抢种、抢建就到哪里。如恩黔高速公路，绕城北线公路规划后，当地一些村民抢种抢建，在地里和房前屋后抢种果树果苗。抢建的房屋建筑更是不伦不类。有的房屋没有窗户，有的房屋甚者连基脚都没有，就是如此简陋不堪的建筑，同样索取高昂的拆迁补偿费，若不满足，则不签字不同意征地拆迁，有的甚至以死相胁迫。
3、协调矛盾问题难度大
征地拆迁补偿费分配难以落实到位。由于部分群众把征地拆迁当作发家致富的大好机遇，想从征地拆迁这块利益蛋糕中多分一点，都想按照有利于自家利益来确定分配方式，吵闹不休，互相观望，致使补偿费长期无法落实到位。这些矛盾和问题，导致协调在短时间内难以到位，从而为项目建设征地拆迁增添无形的压力。
4、安置保障失地农民难
按照现行的征地拆迁补偿政策，大都实行一次性货币补偿方式。失地农民领到几万元的补偿费后，不出几年基本上消耗完，没有一技之长、年老体弱的失地农民，后续生活保障将十分困难，这部分人必将沦为新的贫困“市民”，为将来留下新的社会隐患。
