滞纳金的计算公式很简单，滞纳金=滞纳税款×滞纳天数×滞纳金加收率。在日常税款征收中，滞纳税款直接对应于某个所属期的应纳税款，滞纳税款、滞纳天数比较容易确定，因此滞纳金的计算也确实如上述公式这么简单。但在税收检查中，由于检查所属期跨度较大，涉及的查补税款往往由分别归属于不同纳税所属期的若干笔税款组成，因此滞纳金的计算就显得不那么简单，其公式演变为：滞纳金=∑(查补滞纳税款×滞纳天数×滞纳金加收率)，即各期查增应纳税款、各期对应的滞纳天数和滞纳金加收率之积的和。受各税种应纳税额计算复杂程度、纳税期长短等因素的影响，查补滞纳税款滞纳金计算的复杂程度也不尽相同。在我国目前所征收的税种中，一般纳税人
增值税应纳税额的计算相对复杂于其它税种，因此增值税查补税款滞纳金的计算就显得较为复杂。
