我本人不承认罚款, 我也不承认怎么办

不知道你的具体情况如何，
首先，查处非法营运的只能是道路运输主管机构（交警、授权的城管）。
其次根据《道路运输条例》第六十条道路运输管理机构的工作人员实施监督检查时，应当有2名以上人员参加，并向当事人出示执法证件。不知道你那个有几人还有，根据该条例63条：道路运输管理机构的工作人员在实施道路运输监督检查过程中，对没有车辆营运证又无法当场提供其他有效证明的车辆予以暂扣的，应当妥善保管，不得使用，不得收取或者变相收取保管费用。因此他有权扣车。再有根据《行政处罚法》的规定，对你的罚款数额是较大的（大于2000），实施处罚前应告知你有听证权，你可以申请听证，你申请的他们应当组织听证。对于该罚款，是拿着罚款单，交到银行的不是交给执法人员或者行政机构，而且不是当场交，该罚单还应有处罚机关印章，如交通管理局印章。如果他要你当场交，那么就有猫腻了。如果有违反上述程序基本确定违法无疑。如果你要提起行政诉讼，必须签字使该具体行为生效才行，否则会驳回你。除了外你还可以找该的上级机关或者同级政府申请行政复议