1、按合同约定的计价标准或计价方法结算。尊重合同当事人的约定，充分体现了合同法中的意思自治原则。因工程量或质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订合同时当地建设主管行政部门发布的计价标准或计价方法结算，但施工合同有效而工程竣工验收不合格的，若经修复仍竣工验收不合格的，承包人请求支付工程款，法院不予支持。
2施工合同无效，工程竣工验收合格，仍可以参照合同约定结算。
实践中，合同约定涉及的原则：1、价格标准，约定采用定额，还是清单方法;2、工程量核定及调整的约定，特别是各种变更情况下的工程量调整原则;3、关于签证的原则，怎样才是有效的签证，其形式和内容的要件的约定，以及有效授权的要件，约定明确的管理流程。
