申请了公租房，在买商品房可以吗？另可以得话首付是多少?

只要能符合条件，是可以申请的。
《公共租赁住房管理办法》
第七条
申请公共租赁住房，应当符合以下条件：
（一）在本地无住房或者住房面积低于规定标准；
（二）收入、财产低于规定标准；
（三）申请人为外来务工人员的，在本地稳定就业达到规定年限。 具体条件由直辖市和市、县级人民政府住房保障主管部门根据本地区实际情况确定，报本级人民政府批准后实施并向社会公布。

申请公租房后可以买新房或者承购其他保障性住房的，对买新房是没有任何影响的，只是买了新房后必须退还原来承租的公租房。
具体法条为《公共租赁住房管理办法》第三十一条，内容如下：
承租人有下列情形之一的，应当腾退公共租赁住房：
（一）提出续租申请但经审核不符合续租条件的；
（二）租赁期内，通过购买、受赠、继承等方式获得其他住房并不再符合公共租赁住房配租条件的；
（三）租赁期内，承租或者承购其他保障性住房的。