在确权绘图及登记时是我丈夫的名字,又因卖的宅基确权未下来（可能遗漏）,当时我申请把旧宅（土窑洞现在居住）确权在我名下?

首先，关于宅基地确权的问题，根据现行的法律法规，宅基地使用权是与户主身份紧密相关的。在你丈夫去世后，宅基地的户主变更应当按照法定程序进行。由于儿子当时不在家，无法及时办理户主变更，这确实给确权工作带来了一定的困难。不过，现在上级要求申报存疑问题，这是一个解决问题的好机会。你可以向相关部门说明情况，提供必要的证明材料，如丈夫的死亡证明、家庭关系证明等，申请将宅基地的户主变更为儿子。同时，对于旧宅（土窑洞）的处理，如果当时已经申请确权在你名下，那么这部分宅基地的权益应当是明确的。在申报存疑问题时，可以一并说明旧宅的情况，确保权益不受影响。其他方面，建议你保持与相关部门的沟通，及时了解政策动态和办理进度，以便顺利完成宅基地的确权工作。我是杭州的吴亮律师，如果仍有疑问，欢迎追问或一对一咨询。