我是卖房的,然后过户,要求按照合同让扣除违约金?

这是一种和解的方案，如果你没有异议，这种解决方式未尝不可。
如果不同意可以起诉要求对方继续履行合同支付剩余的房款，理论上说法院也会支持判决。

先看合同对违约金和房租有无明确约定。若有，按约定扣除违约金和对应房租后退还剩余款项。若没约定，违约金可按对方违约给您造成的损失算，房租参考周边同类型房屋租金。建议和对方协商解决，若协商不成，可走法律途径维护权益。