股权转让协议的效力，与是否办理变更登记没有关系。股权转让协议的效力与以下事项有关：
(1)股权转让程序是否符合公司法及公司章程的规定。按照公司法的规定，将股权转让给股东以外的人，需要经过其他股东的过半数同意，还要确保其他股东的优先购买权。公司章程另有规定的，从其规定。
(2)股权转让协议有没有《合同法》第52条规定的合同无效的情形。主要是一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益;恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益;以合法形式掩盖非法目的;损害社会公共利益;违反法律、行政法规的强制性规定。
(3)股权转让是否涉及行政审批手续，如果涉及审批手续的，股权转让合同效力也会有影响。
(4)如果是国有股权转让，则要考虑是否履行了国有资产处置的法定程序。股权转让协议一旦生效，如果没有特殊约定的，即发生股权变动的法律效力。
但是在工商局不办理变更登记，还是面临着一定的法律风险。所以奉劝大家在签了股权变更协议以后，最好及时的到工商局办理相关的手续变更登记。因为前期股权转让的相关程序都已经处理好了以后，忽略到工商局变更登记的这一细节问题也是后患无穷的。
