乙方施工失误导致工程重大安全事故违约金怎么赔偿的。

根据合同法第一百一十四条　当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；
约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。

当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。你们双方已就违约金进行了约定，就按约定办，实际损失无法达成一致时，可以申请有资质的鉴定机构进行鉴定，根据鉴定结果承担责任，如果不能协商或者不愿协商，可以向人民法院提起诉讼。