合同违约金计算土地增值税时能否扣除？

在计算土地增值税时不能，在所得税计算时可以扣除。根据现行土地增值税条例及细则规定，房地产企业在计算增值额时的扣除项目时主要包括以下五项：
（一）取得土地使用权所支付的金额；
（二）开发土地的成本、费用；
（三）新建房及配套设施的成本、费用，或者旧房及建筑物的评估价格；
（四）与转让房地产有关的税金；
（五）财政部法规的其他扣除项目（比如加计扣除部分）。贵公司发生的由于合同违约（如不能按时交房）支付给业主的违约金不属于计算土地增值税时可以扣除的项目。