境外非政府组织申请登记设立代表机构应当经什么同意才可以

应当经业务主管单位同意。
境外非政府组织申请登记设立代表机构，应当经业务主管单位同意。
业务主管单位的名录由国务院公安部门和省级人民政府公安机关会同有关部门公布。
【法律依据】
《中华人民共和国境外非政府组织境内活动管理法》第十一条，境外非政府组织申请登记设立代表机构，应当经业务主管单位同意。
业务主管单位的名录由国务院公安部门和省级人民政府公安机关会同有关部门公布。