离职后建造师证书被企业恶意扣押怎么办

首先要看你的建造师证书考取的过程中是自己自费还是企业出资，如果企业出资，一般要跟你有书面或者口头协议，约定在企业工作的年限或者楼主为企业应尽的义务。
如果选择离职，需要支付企业的出资额。
如果是自费考取的证书，企业无权扣留证书。
解决办法
1、首先与其进行协商，让公司知道并且明确其恶意扣押离职人员证书是违法行为，劳动法明确规定企业不得以任何理由收取职工的押金和证件，其违法行为可以通过当地劳动部门或着法律部门协助解决(跟企业没有签订其他协议)。
可以去劳动仲裁部门进行投诉，这也是通过法律手段要回证件的辅证。
2、如果实在无法取回，可以采用变通的方法，到发证机构申请补办，同时将原来的证件注销。
注销时需要说明原因，比如说已从该企业离职，且企业还欠着工资，企业未按时支付工资导致离职，所以没有给开离职证明，现在的关系很不融洽等等。

《中华人民共和国劳动合同法》第九条
用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。