按实际情况，对于企业承包经营合同纠纷如何处理的问题，个人比较推荐协商解决，协商解决是由合同双方当事人在平等自愿的基础上，根据法律的规定，通过摆事实讲道理解决纠纷的一种办法。自愿、平等及合法是协商解决的基本原则，协商解决的特点在于简便易行，解决纠纷的同时有利于双方的协作，更便于协议的执行。但自愿是协商的基础，在合同纠纷的分歧及标的较大时，协商解决合同纠纷的方式就存在较大的局限性。
综上可以知道，对于企业承包合同纠纷属于劳动纠纷，这是需要就具体的情况来区分的。如果该合同中涉及了劳动者的工资和基本的福利待遇等东西，那么这个合同就会具有劳动合同的性质。一旦，因为这合同引起的纠纷就会成为劳动纠纷，否则，是不属于劳动纠纷的。
