差别在于：发票联由供应商提供，用作购货的凭证以及记录财务收支；而抵扣联则呈交至购货方，以获取抵
扣税务之效。在财务操作上，供应商将发票联纳入账簿进行汇总和计算，置于账务系统内部。而对于抵扣联，它需要经过税务部门认证后才能实现其抵扣税务的功能，并且在完成认证之后，购货方可以根据其进项税金进行相应的
税费扣除，因此抵扣联必须被单独保管与保留，以便日后使用。此外，发票联作为会计记账的重要依据，亦可追溯至每笔消费记录。最后，抵扣联需提交至退税科存档，直至最终被收回并用于税务抵扣之用途。《发票管理办法实施细则》第三条
发票的基本联次包括存根联、发票联、记账联。存根联由收款方或开票方留存备查;发票联由付款方或受票方作为付款原始凭证;记账联由收款方或开票方作为记账原始凭证。省以上税务机关可根据发票管理情况以及纳税人经营业务需要，增减除发票联以外的其他联次，并确定其用途。
